Создание коллекций биообразцов с требуемыми характеристиками и аннотацией:

  • Ткани и биологические жидкости от лиц, страдающих различными заболеваниями
  • Нормальные ткани и биологические жидкости
  • Стандартные и кастомизированные панели тканей
  • Парные панели нормальных и патологических тканей и квадруплеты
  • Комплекты биообразцов разных типов, полученных от одного пациента
  • Лонгитудиальные комплекты биобразцов разных типов

Инвентаризация и ответственное хранение биологических образцов:

  • В жидком азоте (жизнеспособные клетки, жизнеспособные ткани, «замороженные во вспышке» образцы тканей и клеток)
  • -70/80оС (сыворотка, плазма, PAXgene, RNAlater, образцы тканей, РНК)
  • -40оС и -20оС (образцы замороженной цельной крови на выделение ДНК)
  • +4оС (ДНК)
  • При комнатной температуре (мазки, соскобы, парафиновые блоки, стабилизированные образцы слюны)

Аннотирование: введение в базу данных FreezerPro  любой информации, ассоциированной с образцами.

Фиксация образцов различных тканей формалином и приготовление парафиновых блоков (FFPE 

Стабилизация РНК:

  • В тканях (RNAlater, мгновенная заморозка в жидком азоте)
  • В аспирате костного мозга (PAXgene Bone Marrow RNA, мгновенная заморозка в жидком азоте )
  • В периферической крови (PAXgene Blood RNA)

Сохранение жизнеспособных тканей и клеток:

  • Заливка образцов различных тканей в реагенте O.C.T.
  • Заморозка в криосредах, с использованием непрограммируемых замораживателей (CoolCell, MrFrosty)
  • Мгновенная заморозка клеток и фрагментов тканей разных типов в жидком азоте («заморозка во вспышке»)
  • Выделение плазмы крови, включая плазму К2- и К3-ЭДТА, литий- и натрий-гепарановую плазму, цитратную плазму, плазму двойной и тройной открутки по стандартным и кастомизированным протоколам
  • Выделение сыворотки крови
  • Выделение светлого слоя лейкоцитов (buffy coat)
  • Выделение клеточных и жидких фракций биологических жидкостей: мочи, бронхоальвеолярного лаважа (БАЛ), мокроты, синовиальной жидкости, асцитической жидкости
  • Приготовление мазков периферической крови и костного мозга
  • Выделение мононуклеарных клеток периферической крови (МКПК) и костного мозга (МККМ)
  • Магнитный сортинг клеток (MACS)
  • Выделение геномной и эписомной ДНК из различных биологических субстратов, измерение её концентрации
  • Выделение РНК и расчет индекса её целостности (RIN) при помощи анализатора Agilent Technologies BioAnalyzer 2100)
  • Подготовка и охарактеризование гистопрепаратов
  • Диссоциация нормальных и опухолевых тканей с сохранением жизнеспособных фрагментов тканей и суспензии жизнеспособных клеток
  • Установление первичных клеточных культур из клеток разных типов (фибробласты, МСК костного мозга и МСК жировой ткани, и т.д.)
  • Экспансия клеток в стандартных или особых условиях культивирования
  • Приготовление и сохранение кондиционированных сред
  • Обратная транскрипция
  • Профилирование экспрессии генов
  • Генотипирование по SNP и микросателлитным локусам
  • Дизайн праймеров для ПЦР и ОТ-ПЦР
  • Дизайн аллель-специфических праймеров для генотипирования
  • Создание систем для генотипирования на основе ПДРФ (дизайн праймеров и подбор рестриктаз)
  • Дизайн панелей для таргетного секвенирования
  • Аннотирование последовательностей ДНК
  • Дизайн микро- и макрочипов для генотипирования и профилирования экспрессии генов
  • Анализ данных таргетного и полногеномного секвенирования
  • B области создания и администрирования биобанков разного формата
  • По использованию биомедицинских баз данных
  • В области молекулярной и клеточной биологии
  • По применению ПЦР, ПДРФ, секвенирования и микро/макрочипов в лабораторной практике и диагностике